LOMETS是一种依赖模板的下一代结构预测以及三维结构功能注释的方法。首先它通过引入结构域划分和组装模块处理具有多结构域蛋白，并使用基于梯度的优化工具（deepfold）进行三维结构的构建（基于训练的深度学习模型以及排名靠前的模板引导构建）；接着使用COFACTOR工具进行结构功能注释。大规模测试结果显示，新一代的LOMETS性能较前两代有明显提升。
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